2019年3月26日，四部委發布《關于進一步完善新能源汽車推廣應用財政補貼政策的通知》，通知從2019年3月26日起實施，2019年3月26日至2019年6月25日為過渡期。
過渡期期間銷售上牌的燃料電池汽車按2018年對應標準的0.8倍補貼。目前過渡期已過，之后的燃料電池補貼政策尚未發布。
目前出臺的燃料電池汽車補貼政策中，以深圳、佛山禪城區和山西等地區的補貼比例最高，按照與中央1：1的比例補貼。此外，還有河南、六安、長治、佛山等地出臺了加氫站基礎設施建設補貼。
以下為各地具體補貼方案：
北京市
燃料電池汽車按照中央與地方1:0.5比例安排市級財政補助。如中央政策調整，北京市相應政策按照中央政策另行制定。
河南省
省財政按照主要設備投資總額的30％對燃料電池加氫站給予獎勵，同時出臺措施保障燃料電池加氫站配套設施建設用地。
成都市
在中央財政補貼基礎上，給予中央財政單車補貼額50％的市級配套補貼。燃料電池汽車適用于2017年1月1日至2019年12月31日期間。
六安市
對于加氫站的財政補貼最高不超過400萬元。
山西省
在氫燃料電池汽車補貼政策不退坡的前提下，按照中央財政補助1：1的比例給予省級財政補助，并對加氫站和氫燃料加注進行適度補貼。
長治市
對加氫站設施建設和運營補貼。氫燃料電池汽車運行補貼另行制定。
江門市
氫燃料電池汽車專用制氫站谷期用電價格執行市蓄冷電價政策。對2018年1月1日起在市內注冊登記的氫燃料電池汽車，可按燃料電池裝機額定功率進行補貼，最高地方單車補貼額不超過國家單車補貼額度的100%。
鎮江市
燃料電池汽車補貼標準為當年度中央財政相應車型單車補貼額的40％，地方財政補貼總額最高不超過扣除國家補貼后汽車售價的60％。
佛山市
氫能公交車按照同期國家補貼的100%確定地方補貼。
深圳市
2018年6月12日至2018年12月31日上牌的燃料電池汽車：燃料電池乘用車20萬元/輛，燃料電池輕型客車、貨車30萬元/輛，燃料電池大中型客車、中重型貨車50萬元/輛。
佛山市
對加氫站設施建設和運營補貼。2019年12月31日前建成的固定式加氫站最高補貼達到800萬元，撬裝式加氫站最高250萬元。2018-2019年度銷售氫氣價格40元/kg以下，補貼20元/kg；2020-2021年度銷售價格35元/kg以下，補貼14元/kg；2022年度銷售價格30元/kg以下，補貼9元/kg。氫燃料電池汽車運行補貼另行制定。
